La saga Megaman Zero es una secuela de Megaman X y precuela de Megaman ZX. Cuenta la historia de Zero 100 años después de X, cuando es reactivado sin memoria. Debe enfrentar a Copy X y los Cuatro Guardianes de Neo Arcadia mientras ayuda a la resistencia. A lo largo de 4 juegos, Zero lucha contra las amenazas de Neo Arcadia y el Dr. Weil para liberar a la humanidad.