Los formatos de archivos propietarios o cerrados, protegidos por patentes o derechos de autor, tienen desventajas como formatos estándar de facto. Estas restricciones intentan prevenir la ingeniería inversa de los formatos, aunque la ingeniería inversa con fines de interoperabilidad suele ser legal según quienes la practican, dependiendo de las leyes de cada país en relación con las patentes de software.