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Introdução à bioquímica
Simplicidade no complexo:
                                   Classes de biomoléculas
Existem somente 4 classe de macromoléculas na bioquímica cada uma formada por
seu respectivo conjunto de blocos construtivos

CLASSE                           EXEMPLO                      UNIDADE CONSTRUTUVA
                                                                     H      (TIJOLO)
Proteínas                                                              H
                                                                           N
                                                                                    O
                                               insulina                        H
                                                                           H       OH
                                                                                         Amino ácido


Ácidos nucléicos
                                          RNA                                            nucleotídeo
                                          (ácido ribonucléico)
Polissacarídeos
                                                       celulose
                                                                                                açúcar
Lipídeos             O

                         O
                         O

                     O       O

                         O
                                                                                          Ácido graxo
                                                                  O-
                                                                                      (também glicerol e
                                   Triacil glicerol (banha)            O
                                                                                    outros componentes)
ABC da bioquímica
Grupos funcionais presentes nas
           biomoléculas
Hidrocarbonetos   Grupamentos contendo oxigênio
Grupos funcionais presentes nas
           biomoléculas (cont.)
Grupamentos           Grupamentos        Grupamentos
contendo nitrogênio   contendo enxofre   contendo fosfato
Funcionalidade nos sistemas biológicos
Nos sistemas biológicos tudo tem função desde membros, órgãos e tecidos
     Olhosvisão
     Pernaslocomoção
     Intestinodigestão

Isso também é verdade a nível celular
      Eritrócitos (hemácias, células vermelhas do sangue)transporte de O2
      Neurôniossinalização e processamento nervoso

E também é verdade no nível molecular. Tanto para moléculas como para vias
metabólicas
     Anticorpos(proteínas)            Resposta imune
     Enzimas(proteínas)               Catálise
     Glicose                          Combustível biológico
     Via glicolítica                  Obtenção de energia pela oxidação da glicose
     Via da biossíntese de glicogênio Armazenamento de combustível na forma de
                                      glicogênio
Compreender a função de cada sistema bioquímico é muito importante porque só
assim é possível saber porque, afinal de contas, ele existe e como ele interage com
outros sistemas cada um com sua função
Macromoléculas biológicas
Macromolécula      Polimerização       Unidade     Característica           OBS
                                       construtiva notável
Proteínas          Polímero linear     Aminoácido    Catálise               Muitas funções
                                                                            Extremamente
                                                                            versátil quanto à
                                                                            forma e à função
Ácidos nucléicos Polímero linear       Nucleotídeo   Auto replicação

Polissacarídeos    Polímero            Monos-        Usado como             A celulose á a
                   linear/ramificado   sacarídeos     Reserva de energia   biomolécula mais
                                                     Estruturas muito      abundante na Terra
                                                     resistentes
Lipídeos           Não são polímeros Ácido graxo     Forma membranas        Muito variados
                                       e outros                             quanto as unidades
                                                                            constitutivas
Composição percentual de
biomoléculas numa célula bacteriana
                                  % do    Número de
                                  peso    moléculas    % do
                                  total   deste tipo   peso
      Água                         70         1        seco
      Proteínas                    15       3.000      50
      Ácidos         DNA            1         1        3,3
      nucléicos                                        20
                     RNA            6       >3.000
      Polissacarídeos               3         ~5       10
      Lipídeos                      2        ~20       6,6
      Monômeros e                   2        ~500      6,6
      intermediários
      Íon inorgânicos               1        ~20       3,3
      (Ca2+, Na+, K+, PO42-...)
Hierarquia estrutural na
organização molecular da célula




   Célula    Organelas Macromoléculas    Unidades
                                        Monoméricas
   Nível 4    Nível 3      Nível 2        Nível 1
Poucos dos 112 elementos são
utilizados nos organismos vivos

                             H + O > 70%
                             H+O+C>95%
                             H+O+C+P>98%


                              macroelementos

                               Microelementos
                               (oligoelementos)
Bactéria que se alimenta de arsênio
Cientistas norte-americanos descobrem bactéria que se alimenta de
arsênio, elemento considerado altamente tóxico, em substituição a
outro que seria essencial à sua condição de ser vivo.
Publicado em 02/12/2010 | Atualizado em 08/12/2010
“A vida como nós a conhecemos exige
elementos químicos específicos e exclui outros”,
afirma um dos autores do artigo, Ariel Anbar
Esse é o primeiro caso em que um
microrganismo é capaz de substituir algum dos
seis elementos essenciais à vida (carbono,
hidrogênio, nitrogênio, oxigênio, enxofre e
fósforo).
De acordo com os pesquisadores, as bactérias
são capazes de incorporar esse novo elemento ao
                                                   O lago em que foi encontrada a nova bactéria é
próprio DNA.                                       conhecido por ser altamente salino e ter altas
                                                   concentrações de arsênio




                                                     http://cienciahoje.uol.com.br/noticias
Composição percentual elementar do corpo humano
  Abundância relativa dos elementos (%)
   Crosta Terrestre    Corpo Humano



  O     47,0          H           63,0
                                                 99,4%    macroelementos
  Si    28,0          O           25,5

  Al      7,9         C            9,5

  Fe      4,5         N            1,4                    microelementos
                                                  0,6%    (oligoelementos)
  Ca      3,5         Ca           0,31

  Na      2,5         P            0,22
  Tanto os macroelementos como os oligoelementos são igualmente essenciais à vida!!!
  K       2,5         Cl           0,08
Escala de tamanho em bioquímica
alanina
(aminoácido)




   0,5nm
   89Da                 3,5nm




  glicose

   0,7nm
   180Da       Fosfolipídeo     Mioglobina (uma proteína pequena)
               750Da            16.900Da
Escala de tamanho em bioquímica
             (cont.)
Mioglobina
16.900Da



             3,5nm
                                                    6,8nm




                     Hemoglobina (proteína média)
                     65.000Da
Escala de tamanho em bioquímica
                 (cont.)


Hemoglobina
                               25nm
  65.000Da
                                                              16nm
        6,8nm
                Bacteriófago ΦX-174
                Um dos menores vírus conhecidos   Ribossoma de E.Coli
                6.200.000Da                       2.800.000Da




                            miosina

                            160nm
                            470.000Da
Escala de tamanho em bioquímica
             (cont.)


   miosina
   160nm
   470.000Da




               Vírus do mosaico do tabaco
               300nm
               40.000.000Da
Escala de tamanho em bioquímica
              (cont.)
                            Hemácia
                   (célula vermelha
          20.000nm       do sangue)
          20µm

Célula                     Vírus do
                           mosaico
                           do tabaco
                                              9.000nm
                                              9µm



  do               Cloroplasto de
                   espinafre
                                          Mitocôndria
                                          de hepatócito


fígado                                           1,5µm


                                                          E coli
                                                          bactéria

                                8.000nm
                                8µm            2.000nm
                                               2µm
Escala de tamanho das
Hemoglobina 6,8nm



                                 estruturas biológicas
                 Vírus ΦX-174
                        25nm    Hemácia 9µm
alanina                                                    20µm
(0,5nm)                                                             Humano
                                                                    1,7 m


                         Mitocôndria                       Célula
                              1,5µm    Vírus do              do
                                       mosaico do          fígado
                                       tabaco
                                       300nm
      glicose 0,7nm


Nanômetro               Micrômetro                  Milímetro       Metro
(nm)                    (µm)                        (mm)            (m)
10-9 metro              10-6 metro                  10-3 metro      100 metro
Origem das biomoléculas
                        Eletrodos             Compostos produzidos neste experimento
                                              Glicina (aminoácido)
                                              Alanina (aminoácido)
                                              Acido α-aminobutírico
                                              N-metil alanina
           Centelhas



                                              Ác. Aspártico (aminoácido)
                                              Ác. glutâmico (aminoácido)
                                              Ác. Acético
                                              Ác succínico (intermediário do ciclo de Krebs)
                                              Uréia
                                                        ...muitos outros
          Condensador

                             Mistura de
                             NH3 (amônia)
                             H2(hidrogênio)
                             CH4 (metano)
                             e água 80oC
Aparelho para demonstrar a abiótica
formação de biomoléculas simulando
as condições da atmosfera primitiva
Um esquema possível para a evolução
               molecular Surgimento da Terra
                           4,5 Bilhões de anos

“Sopa” pré-biótica contendo diversas biomoléculas
originadas de precurssores na atmosfera primitiva

Produção de pequenas moléculas de RNA com
seqüências aleatórias

Surgimento de moléculas de RNA com atividade
                                                       4,0 Bilhões de anos
catalítica auto-replicativa
                                                       Formação dos oceanos e
                                                       continentes
Síntese de peptídeos catalizada por RNA

Co-evolução do RNA e das proteínas

Desenvolvimento de um sistema de tradução primitivo.
Genoma de RNA e catalizadores RNA-Proteína

                                                       3,5 Bilhões de anos
Surgimento do genoma de DNA                            Primeiro
                                                       microorganismo fóssil

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001 intoducao

  • 2. Simplicidade no complexo: Classes de biomoléculas Existem somente 4 classe de macromoléculas na bioquímica cada uma formada por seu respectivo conjunto de blocos construtivos CLASSE EXEMPLO UNIDADE CONSTRUTUVA H (TIJOLO) Proteínas H N O insulina H H OH Amino ácido Ácidos nucléicos RNA nucleotídeo (ácido ribonucléico) Polissacarídeos celulose açúcar Lipídeos O O O O O O Ácido graxo O- (também glicerol e Triacil glicerol (banha) O outros componentes)
  • 4. Grupos funcionais presentes nas biomoléculas Hidrocarbonetos Grupamentos contendo oxigênio
  • 5. Grupos funcionais presentes nas biomoléculas (cont.) Grupamentos Grupamentos Grupamentos contendo nitrogênio contendo enxofre contendo fosfato
  • 6. Funcionalidade nos sistemas biológicos Nos sistemas biológicos tudo tem função desde membros, órgãos e tecidos Olhosvisão Pernaslocomoção Intestinodigestão Isso também é verdade a nível celular Eritrócitos (hemácias, células vermelhas do sangue)transporte de O2 Neurôniossinalização e processamento nervoso E também é verdade no nível molecular. Tanto para moléculas como para vias metabólicas Anticorpos(proteínas) Resposta imune Enzimas(proteínas) Catálise Glicose Combustível biológico Via glicolítica Obtenção de energia pela oxidação da glicose Via da biossíntese de glicogênio Armazenamento de combustível na forma de glicogênio Compreender a função de cada sistema bioquímico é muito importante porque só assim é possível saber porque, afinal de contas, ele existe e como ele interage com outros sistemas cada um com sua função
  • 7. Macromoléculas biológicas Macromolécula Polimerização Unidade Característica OBS construtiva notável Proteínas Polímero linear Aminoácido Catálise Muitas funções Extremamente versátil quanto à forma e à função Ácidos nucléicos Polímero linear Nucleotídeo Auto replicação Polissacarídeos Polímero Monos- Usado como A celulose á a linear/ramificado sacarídeos  Reserva de energia biomolécula mais Estruturas muito abundante na Terra resistentes Lipídeos Não são polímeros Ácido graxo Forma membranas Muito variados e outros quanto as unidades constitutivas
  • 8. Composição percentual de biomoléculas numa célula bacteriana % do Número de peso moléculas % do total deste tipo peso Água 70 1 seco Proteínas 15 3.000 50 Ácidos DNA 1 1 3,3 nucléicos 20 RNA 6 >3.000 Polissacarídeos 3 ~5 10 Lipídeos 2 ~20 6,6 Monômeros e 2 ~500 6,6 intermediários Íon inorgânicos 1 ~20 3,3 (Ca2+, Na+, K+, PO42-...)
  • 9. Hierarquia estrutural na organização molecular da célula Célula Organelas Macromoléculas Unidades Monoméricas Nível 4 Nível 3 Nível 2 Nível 1
  • 10. Poucos dos 112 elementos são utilizados nos organismos vivos H + O > 70% H+O+C>95% H+O+C+P>98% macroelementos Microelementos (oligoelementos)
  • 11. Bactéria que se alimenta de arsênio Cientistas norte-americanos descobrem bactéria que se alimenta de arsênio, elemento considerado altamente tóxico, em substituição a outro que seria essencial à sua condição de ser vivo. Publicado em 02/12/2010 | Atualizado em 08/12/2010 “A vida como nós a conhecemos exige elementos químicos específicos e exclui outros”, afirma um dos autores do artigo, Ariel Anbar Esse é o primeiro caso em que um microrganismo é capaz de substituir algum dos seis elementos essenciais à vida (carbono, hidrogênio, nitrogênio, oxigênio, enxofre e fósforo). De acordo com os pesquisadores, as bactérias são capazes de incorporar esse novo elemento ao O lago em que foi encontrada a nova bactéria é próprio DNA. conhecido por ser altamente salino e ter altas concentrações de arsênio http://cienciahoje.uol.com.br/noticias
  • 12. Composição percentual elementar do corpo humano Abundância relativa dos elementos (%) Crosta Terrestre Corpo Humano O 47,0 H 63,0 99,4% macroelementos Si 28,0 O 25,5 Al 7,9 C 9,5 Fe 4,5 N 1,4 microelementos 0,6% (oligoelementos) Ca 3,5 Ca 0,31 Na 2,5 P 0,22 Tanto os macroelementos como os oligoelementos são igualmente essenciais à vida!!! K 2,5 Cl 0,08
  • 13. Escala de tamanho em bioquímica alanina (aminoácido) 0,5nm 89Da 3,5nm glicose 0,7nm 180Da Fosfolipídeo Mioglobina (uma proteína pequena) 750Da 16.900Da
  • 14. Escala de tamanho em bioquímica (cont.) Mioglobina 16.900Da 3,5nm 6,8nm Hemoglobina (proteína média) 65.000Da
  • 15. Escala de tamanho em bioquímica (cont.) Hemoglobina 25nm 65.000Da 16nm 6,8nm Bacteriófago ΦX-174 Um dos menores vírus conhecidos Ribossoma de E.Coli 6.200.000Da 2.800.000Da miosina 160nm 470.000Da
  • 16. Escala de tamanho em bioquímica (cont.) miosina 160nm 470.000Da Vírus do mosaico do tabaco 300nm 40.000.000Da
  • 17. Escala de tamanho em bioquímica (cont.) Hemácia (célula vermelha 20.000nm do sangue) 20µm Célula Vírus do mosaico do tabaco 9.000nm 9µm do Cloroplasto de espinafre Mitocôndria de hepatócito fígado 1,5µm E coli bactéria 8.000nm 8µm 2.000nm 2µm
  • 18. Escala de tamanho das Hemoglobina 6,8nm estruturas biológicas Vírus ΦX-174 25nm Hemácia 9µm alanina 20µm (0,5nm) Humano 1,7 m Mitocôndria Célula 1,5µm Vírus do do mosaico do fígado tabaco 300nm glicose 0,7nm Nanômetro Micrômetro Milímetro Metro (nm) (µm) (mm) (m) 10-9 metro 10-6 metro 10-3 metro 100 metro
  • 19. Origem das biomoléculas Eletrodos Compostos produzidos neste experimento Glicina (aminoácido) Alanina (aminoácido) Acido α-aminobutírico N-metil alanina Centelhas Ác. Aspártico (aminoácido) Ác. glutâmico (aminoácido) Ác. Acético Ác succínico (intermediário do ciclo de Krebs) Uréia ...muitos outros Condensador Mistura de NH3 (amônia) H2(hidrogênio) CH4 (metano) e água 80oC Aparelho para demonstrar a abiótica formação de biomoléculas simulando as condições da atmosfera primitiva
  • 20. Um esquema possível para a evolução molecular Surgimento da Terra 4,5 Bilhões de anos “Sopa” pré-biótica contendo diversas biomoléculas originadas de precurssores na atmosfera primitiva Produção de pequenas moléculas de RNA com seqüências aleatórias Surgimento de moléculas de RNA com atividade 4,0 Bilhões de anos catalítica auto-replicativa Formação dos oceanos e continentes Síntese de peptídeos catalizada por RNA Co-evolução do RNA e das proteínas Desenvolvimento de um sistema de tradução primitivo. Genoma de RNA e catalizadores RNA-Proteína 3,5 Bilhões de anos Surgimento do genoma de DNA Primeiro microorganismo fóssil

Notas do Editor

  • #11: Resumo do slide: Poucos dos 112 elementos são utilizados nos sistemas biológicos. Os bioelemento podem ser classificados em macroelementos e oligoelementos de acordo com sua abundância. Destes, C, H, O, N e P tem um papel destacado.
  • #12: RESUMO DO SLIDE
  • #13: RESUMO DO SLIDE A composição elementar dos organismos vivos é bem diversa da do ambiente de onde eles retiram esses elementos. C, H, O e N juntos somam mais de 99% da biomassa. Os microelementos, embora usados em pequena quantidade, são indispensáveis à vida