Slider biopython
- 1. 1
- 2. 2
- 3. 3 QUEM SOU EU ? ● Higor Vinicius ● Tecnologo em Processamento de Dados – AESPI ● Usuario Linux ● Entusiasta da Linguagem Python ● Integrante do PUG
- 4. 4
- 5. 5 O que é Bioinformática ? O que é Biopython ? A resposta seria : + E python? 0 que vem a ser pyhton?
- 6. 6 Muitas perguntas vem na sua cabeça ao mesmo tempo não é ?
- 7. 7 Bioinformática A bioinformática é um campo interdisciplinar que desenvolve métodos e ferramentas de software para a compreensão de dados biológicos. Fonte : https://en.wikipedia.org/wiki/Bioinformatics
- 8. 8 Biopython O Biopython é um conjunto de ferramentas livremente disponíveis para computação biológica escrita em Python por uma equipe internacional de desenvolvedores. Fonte :http://biopython.org/wiki/Biopython
- 9. 9 ● Python é uma linguagem de programação de alto nível, interpretada, de script, imperativa, orientada a objetos, funcional, de tipagem dinâmica e forte. ● Foi lançada por Guido van Rossum em 1991. ● Atualmente possui um modelo de desenvolvimento comunitário, aberto e gerenciado pela organização sem fins lucrativos a Python Software Foundation. Fonte : https://pt.wikipedia.org/wiki/Python Github : https://github.com/python/
- 10. 10 Porque resolvi falar de Biopython? ● Minha namorada ama Biologia ● Eu amo programar em pythhon Ai veio a ideia... Por que não juntar as duas coisas ? Biologia + Python
- 11. 11 O quê será abordado? ● Transcrição - vamos transcrever de DNA para RNA . ● Tradução - vamos traduzir de RNA para Proteína . ● Arquivos FASTA - é um dos padrões de armazenamento de sequências Biológicas .
- 12. 12 DNA ● DNA é uma abreviatura (em inglês) de ácido desoxirribonucléico.
- 13. 13 DNA ● DNA é um aglomerado de moléculas que contém material genético. ● Vários estudos foram e estão sendo feitos utilizando o DNA. ● Um exemplo desses estudos é o Projeto Genoma que busca mapear o DNA. Fonte :https://pt.wikipedia.org/wiki/Projeto_Genoma
- 14. 14 RNA ● RNA é a sigla de ácido ribonucléico. ● A composição do RNA é muito semelhante ao do DNA,porém apresenta algumas diferenças como: o RNA é formado por uma cadeia simples, e não uma de dupla hélice como o DNA.
- 15. 15
- 16. 16 Transcrição ● A transcrição é a síntese de RNA cuja sequência foi definida pelo molde DNA. ● Segmento de DNA: ATGCC ● Segmento De RNAm formado na transcrição: AUCGG ● Com o fim da transcrição, as duas fitas de DNA se unem ● novamente refazendo-se a dupla hélice .
- 17. 17 Transcrição ● Lembrando: transcrição é local! ● Apenas algumas regiões do DNA servem de molde para a síntese de um RNA . ● Apenas uma fita serve de molde para a síntese de RNA. ● A outra fita tem a sequência igual ao RNA com a diferença ● que possui T no lugar de U. ● A fita que serviu de molde para a síntese de RNA é chamada de fita non sense. ● A outra fita é a fita sense (codante). Essa fita não interfere no processo, mas ela contém os códons.
- 18. 18
- 19. 19 Proteínas As proteínas são macromoléculas formadas por uma sucessão de moléculas menores conhecidas como aminoácidos. A maioria dos seres vivos, incluindo o homem, utiliza somente cerca de vinte tipos diferentes de aminoácidos para a construção de suas proteínas.
- 20. 20 E o codigo cadê ? Afinal de contas e python misturado com biologina né ?
- 21. 21 TRADUÇÃO
- 22. 22
- 23. 23 TRANSCRIÇÃO
- 24. 24
- 26. 26
- 27. 27 Que tal uma pequena aplicação para brincar com biopython ?
- 28. 28 Vamos usar uma microframework Github : https://github.com/HigorMonteiro/flask_biopython/
- 29. 29 Obrigado!!! Isso e tudo pessoal (-: facebook : https://www.facebook.com/hygor.vinicius.1 gmail : higor.tecinfor@gmail.com github: https://github.com/HigorMonteiro/ twitter: https://twitter.com/pyhygor