MPI-2, introducând standarde de comunicație pentru aplicații paralele, a fost lansat în 1996 și aduce peste 500 de funcții, inclusiv managementul proceselor dinamice și comunicarea I/O paralel. Acesta oferă funcționalități avansate precum tipuri de date derivate și optimizări pentru stocarea colectivă, abordând limitările versiunii anterioare, MPI-1.2. Viitorul include îmbunătățiri cu MPI-3, care va adăuga suport pentru multithreading și toleranță la erori.