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- 1. 关于超级计算环境 迟学斌 中国科学院计算机网络信息中心 超级计算中心 2002 年 7 月 20 日
- 2. 内容 动机 硬件平台建设 系统应用软件 基础并行软件平台 科学计算平台 应用领域 网格试验平台建设 我们的目标
- 3. 动机 “ 十五”院信息化基础设施 改善科学研究所需的计算环境 更好地为我院知识创新工作服务 提高我院在超级计算领域的影响 国际发展动态 美国、欧洲和日本 （ 98% ） Earth Simulator ， 40 万亿次 众多超级计算中心
- 4. 动机 国内发展状况 曙光系列 ， 神威系列 ， 银河系列 国家高性能计算中心 CERNET 高性能计算中心 北京市高性能计算机应用中心 上海超级计算中心 北京应用物理与计算数学研究所高性能中心 中科院计算机网络信息中心
- 5. 动机 院内需求分析 区域气候－环境－生态耦合模式 需要 2.5—3G 的内存， 40—50G 的硬盘，主频 500M Hz 的单 CPU ，大约需要运行 8 个月 第一原理材料设计 处理几百甚至上千个原子的体系；需要 7G 内存， 50G 硬盘， 64 个 Fe 原子体系， 1 个 k 点 (Gamma) ， 12500 个平面波， 384 个能带，基态，无结构弛豫， SP3 上 128 个节点并行时间为 12 分钟
- 6. 硬件平台建设 超级计算机（ 2TFLOPS ） 集群计算机系统（ cluster ） 大规模计算机系统（ MPP ） 共享存储计算机系统（ SMP ） 海量存储系统（ 100TB ） 磁盘阵列（ RAID ） 磁带库（ RAIT ）
- 7. 系统应用软件 用户使用环境 网格技术（ Grid Technology ） GLOBUS GPDK 异构系统资源的统一管理 网络计算服务
- 8. 基础并行软件平台 数值代数软件 BLAS LAPACK ScaLAPACK 偏微分方程数值求解软件 PETSc 快速富氏变换 FFTW
- 9. 科学计算平台 生物信息学 利用 EST 数据库发现新基因 地质与地球物理科学 三维地震成像数值模拟 材料科学 第一原理材料设计 聚合物加工过程的基础研究
- 10. 科学计算平台 计算机辅助药物分子设计和药物筛选 生态环境 区域气候、环境和生态数值模拟 基础科学和应用科学 高精度差分方程与复杂流动的数值模拟 大系统的稳定性和分枝 网格并行自动生成器
- 11. 应用领域 生物信息学 基因组序列拼接 蛋白质结构预测 材料科学 高温液态分子结构分析 生态环境 环境监控与预报数值模拟
- 12. 网格试验平台建设 grid.ustc.edu.cn WAN grid.ncic.ac.cn 入口： grid.nhpc.ac.cn 155Mbps 教育网 1Gbps 校园网 东区、西区、安大 10Mbps 科研网 100Mbps 园区网 曙光 2000 、曙光 3000 grid.cnc.ac.cn
- 13. 我们的目标 十六字：建立中心、完善环境、奠定基础、探索途径 建立中心 - 建立具有世界水准的、我院的超级计算中心（万亿次计算能力、万亿字节存储能力） 完善环境 - 完善我院科学计算环境 奠定基础 - 奠定网格计算的坚实基础 探索途径 - 探索通过计算进行科学发现的有效途径
- 14. 敬请专家领导指正！ 谢谢！