Grupo de epigenética del cáncer. David Guerrero-Setas, Navarra Biomed

Dr. David Guerrero
Responsable del Grupo de Epigenética del Cáncer
GRUPO DE EPIGENÉTICA DEL CÁNCER:
LÍNEA DE TRABAJO PRESENTE Y FUTURA

CENTRO DE INVESTIGACIÓN NAVARRABIOMED
Áreas de investigación: Cáncer, Patologías de Grandes Sistemas, Neurociencias,
Salud Mental y Vigilancia Epidemiológica, Salud Pública y Servicios Sanitarios
www.navarrabiomed.es
2002-2013 2014-actual

Centro localizado junto al Pabellón de Radioterapia, en el Complejo
Hospitalario de Navarra

Detección de nuevos biomarcadores epigenéticos y moléculas reguladoras de la
expresión génica (smallRNAs) con posible valor pronóstico y de predicción de
respuesta al tratamiento oncológico en pacientes con cáncer de mama esporádico, y
otros tipos de cáncer (cáncer ginecológico y tumores cerebrales).
Colaboraciones
Investigación multicéntrica
+
Componentes: Personal básico (pre-doc, post-doc) de Navarrabiomed y clínico
investigador de los Servicios de Anatomía Patológica, Cirugía General, Oncología Médica
y Oncología Radioterápica del CHN.
OBJETIVO Y COMPONENTES DEL GRUPO DE EPIGENÉTICA DEL CÁNCER

PROYECTOS EN CÁNCER DE MAMA
 Título: Análisis del Metiloma y Proteoma en los subtipos de expresión de
cáncer de mama ductal infiltrante. Investigador principal (IP): Dr. David
Guerrero Setas (Epigenética del Cáncer, Navarrabiomed-FMS) (2012-2015)
 Title: Analysis of expression profiles of non-coding RNAs by ultra-
sequencing. IP: Dr. David Guerrero Setas (Cancer Epigenetics, Navarrabiomed-
FMS). REFBio Pyrenees Biomedical Network from European Union. (October
2013-February 2015).
 Título: Análisis de genes alterados por metilación en relación con la
respuesta al tratamiento oncológico en pacientes con cáncer de mama de mal
pronóstico. IP: Dr. David Guerrero Setas (Navarrabiomed-FMS) (2015).
Fundación Caja Navarra.
 Título: Efectos de agentes anti-neoplásicos en la regulación funcional,
epigenética y proteómica de las células mileoides supresoras en cáncer de
mama. IP: Dr. Escors (Immunomodulación del Cancer, Navarrabiomed-FMS).
Fundación Sandra Ibarra (2014-2016).

 Título: Análisis de la expresión diferencial de miRNAs e hipermetilación de genes
en relación con el pronóstico y respuesta al tratamiento en cáncer de mama. IP:
Dra. Córdoba (Servicio AP, CHN, SNS). 2011-2013.
Nuevas convocatorias
 Título: Análisis de variables clínicas, anatomopatológicas y moleculares en los
subtipos de expresión de cáncer de mama. IP: Dr. Guerrero Setas (Centro de
Investigación Biomédica, SNS. Departamento de Salud, Gobierno de Navarra
(2009-2011).
 Título: Análisis de la correlación entre el patrón molecular de los genes CDH-1 y
SIAH-1 y las características clínicas y anatomopatológicas de pacientes navarras
con carcinoma ductal de mama. IP: Dr. Vicente (Servicio de Cirugía General y
Digestiva, CHN, SNS). Departamento de Salud, Gobierno de Navarra (2005-2007).
 Título: Estudio de grado de apoptosis, adhesión celular y resistencia in vitro a
quimioterápicos como marcadores de agresividad tumoral en pacientes con
carcinoma ductal infiltrante de mama. IP: Dr. Vicente (Servicio de Cirugía General
y Digestiva, CHN, SNS). Departamento de Salud, Gobierno de Navarra (2003-2005).

PUBLICACIONES DEL GRUPO
•Perez-Janices N, Torrea N, Blanco-Luquin I, y cols. Differential involvement of RASSF2
hypermethylation in breast cancer subtypes and their prognosis. Oncotarget 2015 (accepted).
Factor de impacto 2013 (FI): 6.63
•Blanco-Luquin I, Guarch R, Ojer A, y cols. Differential role of gene hypermethylation in
adenocarcinomas, squamous cell carcinomas and cervical intraepithelial lesions of the uterine
cervix. Pathol Int 2015 (under review).
•Perez-Janices N, Blanco-Luquin I, Tuñón M, y cols. EPB41L3, TSP-1 and RASSF2 as new clinically
relevant prognostic biomarkers in diffuse gliomas. Oncotarget 2015 Jan 1;6(1):368-80. FI: 6.63
•Guerrero-Setas D, Pérez-Janices N, Blanco-Fernandez L, y cols. RASSF2 hypermethylation is
present and related to shorter survival in squamous cervical cancer. Mod Pathol 2013; 26(8):1111-
22. PMID: 23542458. FI : 6.364
•Guerrero-Setas D, Pérez-Janices N, Blanco-Fernandez L, y cols. Differential gene
hypermethylation in genital lichen sclerosus and cancer: a comparative study. Histopathology
2013; 63(5):659-69. PMID: 23998425. IF 2013: 3.301
•Arrazubi V, Suarez J, Guerrero D, y cols. Prognostic significance of thymidylate synthase
polymorphism in rectal cancer patients treated with neoadjuvant chemoradiotherapy. Colorectal
Dis 2013; 15(4):428-35. PMID: 22958523. FI: 2.081

• Guerrero D, Guarch R, Ojer A, y cols. Hypermethylation of the thrombospondin-1 gene is
associated with poor prognosis in penile squamous cell carcinoma. BJU Int 2008; 102(6):747-55.
PMID: 18336597. FI: 3.13
• Bertolo C, Guerrero D, Vicente F, y cols. Differences in molecular and immunohistochemical
parameters in the subtypes of infiltrating ductal breast cancer. Am J Clin Pathol 2008; 130(3):414-
24. PMID: 18701415. FI: 3.005
Nuevas publicaciones en cáncer de mama:
 Tres nuevos artículos en preparación, de trabajos ya realizados:
-Estudio realizado en aprox. 700 pacientes acerca de los subtipos tumorales.
-Estudio molecular en ganglio centinela.
-Descripción de nuevos genes metilados en subtipos tumorales.
 Nuevas publicaciones con los resultados de los proyectos en desarrollo.
• Guerrero D, Guarch R, Ojer A, y cols. Differential hypermethylation of genes in vulvar cancer and
lichen sclerosus coexisting or not with vulvar cancer. Int J Cancer 2011; 128 (12): 2853-64. PMID:
20734389. FI: 6.198

PUBLICACIONES EN COLABORACIÓN CON OTROS GRUPOS
• Liechtenstein T, Perez-Janices N, Gato M, y cols. A highly efficient tumor-infiltrating MDSC
differentiation system for discovery of anti-neoplastic targets, which circumvents the need for
tumor establishment in mice. Oncotarget 2014;5(17):7843-57. FI: 6.63
• Kochan G, Escors D, Breckpot K, Guerrero-Setas D. Role of non-classical MHC class I molecules
in cancer immunosuppression. Oncoimmunology 2013; 2(11):e26491. PMID: 24482746. FI: 6.28
• Escors D, Liechtenstein T, Perez-Janices N, y cols. Assessing T-cell responses in anticancer
immunotherapy dendritic cells or myeloid-derived suppressor cells?. Oncoimmunology 2013;
2(10):e26148. PMID: 24244902. FI: 6.28
• Liechtenstein T, Perez-Janices N, Bricogne C, y cols. Immune modulation by genetic
modification of dendritic cells with lentiviral vectors. Virus Res 2013; 176(1-2):1-15.
PMID:23726846. FI: 2.812
• Lopez-Serra L, Ballestar E, Ropero S, y cols. Unmasking of epigenetically silenced candidate
tumor suppressor genes by removal of methyl-CpG-binding domain proteins. Oncogene 2008;
27(25):3556-66. PMID: 18223687. IF 2013: 8.559
• Agrelo R, Cheng WH, Setien F, y cols. Epigenetic inactivation of the premature aging Werner
syndrome gene in human cancer. Proc Natl Acad Sci USA 2006; 103(23):8822-7. PMID:
16723399. IF: 9.809

ENFOQUE DE ESTUDIOS: PASADO Y PRESENTE
Ahora: Múltiples genes al mismo tiempo
Selección de genes alterados
Antes: Gen a Gen

ESQUEMA GENERAL DE TRABAJO DE LABORATORIO
Selección de genes alterados
Estudio de la frecuencia de las alteraciones en tumores de
distintos subtipos y análisis de su implicación clínica
Arrays de metilación
Secuenciación de última Generación
(NGS)
Técnicas de Proteómica
Estudio funcional en líneas celulares
mediante lentivirus

LÍNEA DE FUTURO
 Selección de nuevos genes candidatos que pueden metilarse o expresarse de
forma anómala, que ya han sido detectados mediante técnicas de última
generación.
 Análisis in vitro de su papel funcional, incluyendo estudios de toxicidad frente a
fármacos habituales en clínica.
 Análisis del valor clínico de los genes candidatos en pacientes con cáncer de
mama de distintos subtipos patológicos.
PACIENTES CON CÁNCER DE MAMA TRIPLE-NEGATIVO (ER, PR, HER2 -)

Tumor sólido Biomarcador Fármaco Centros Año de
inicio
Tipo de
técnica
Cáncer de colon Mutaciones de genes K-RAS,
N-RAS
Cetuximab CHN, HRS 2009 (K-RAS) /
2014 (N-RAS)
Molecular
Cáncer de pulmón
Mutaciones del gen EGFR Erlotinib,
Gefitinib
CHN, HRS 2011 322
Cáncer de mama Amplificación del gen HER2 Trastuzumab CHN 2009 Citogenética
(FISH)
Cáncer de mama Amplificación del gen HER2 Trastuzumab CHN 2009 Citogenética
(FISH)
Tipo de cáncer Biomarcador Clínica Centros Año de
inicio
Tipo de
técnica
Cáncer de colon Mutaciones del gen BRAF Pronóstico CHN, HRS 2013 Molecular
Oligodendroglioma Codeleción 1p/19q Pronóstico CHN 2009 Citogenética
(FISH)
LABORATORIO DE BIOLOGIA MOLECULAR
Biomarcadores predictivos de respuesta al tratamiento oncológico o con valor pronóstico
Cáncer de pulmón
Mutaciones del gen EGFR Erlotinib,
Gefitinib
CHN, HRS Mar_2011 Molecular
Reordenamientos EML-ALK Crizotinib CHN, HRS Nov_2011 Citogenética
(FISH)
HOSPITAL REINA
SOFIA,TUDELA

CONVENIO DE COLABORACIÓN CON LA ASOCIACIÓN SARAY: MAYO 2015-MAYO 2016.

Agradecimientos…
Anatomía Patológica
Cirugía General y Digestiva
Oncología Médica y Oncología Radioterápica
SARAY
Departamento de Salud (Gobierno de Navarra)
Centro Nacional de Investigaciones Oncológicas (CNIO, Madrid)
Programa de Epigenética y Biología del Cáncer (IDIBELL, Barcelona)
Laboratorio de Epigenética del Cáncer (IUOPA, Oviedo)
PACIENTES
Biobanco
Documentación Gráfica
Unidad de Gestión de ayudas y personal administrativo
Grupo de investigación en Inmunomodulación
Grupo de investigación Clínica en Oncología Médica
Personal técnico (TEL y TEAP)
Plataforma de Proteómica
Unidad de Metodología
Fundación Vasca de Investigación e Innovación Sanitarias (BIOEF)
Plataforma de Genómica, Centro de Investigación Biomédica de La Rioja
(CIBIR)

www.navarrabiomed.es info.navarrabiomed@navarra.es
Dr. David Guerrero
Responsable del Grupo de Epigenética del Cáncer
dguerres@navarra.es

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