La acuicultura ha incrementado considerablemente su producción en los últimos años, especialmente en ambientes continentales. La pesca de captura se ha estabilizado. El cultivo de peces amazónicos se concentra en especies nativas como la gamitana, el paco y el sábalo, y está emergiendo el cultivo del paiche. Actualmente la producción de peces amazónicos de la acuicultura solo representa el 1.13% de la producción acuícola nacional.