El virus Marburgo fue aislado por primera vez en 1967 en Marburgo, Alemania tras una epidemia entre personal de laboratorio que había estado en contacto con riñones de monos infectados. Desde entonces se han reportado brotes esporádicos en África, incluyendo uno entre mineros en la República Democrática del Congo en 1998-2000 que causó 154 infecciones y 128 muertes. El virus se cree que es una zoonosis pero su reservorio animal aún no ha sido identificado.