Un curso en Moodle está organizado en tres tipos de elementos: módulos de comunicación para permitir interacción entre estudiantes y profesor, módulos de materiales que contienen los contenidos del curso como textos y presentaciones, y módulos de actividades donde los estudiantes completan tareas. El curso se divide en temas que contienen estos elementos y se muestran en la columna central, mientras que los bloques en las columnas laterales ofrecen herramientas adicionales como un calendario.