La limpieza y transformación de datos es necesaria para obtener datos de alta calidad para el proceso de minería de datos. Esto involucra integrar datos de múltiples fuentes, identificar y corregir valores faltantes, erróneos o duplicados, y transformar los datos mediante discretización, numerización u otras técnicas. Un sistema ETL (extracción, transformación y carga) automatiza este proceso mediante la extracción de datos, su transformación y carga en un almacén de datos.