Facultad de Medicina y Ciencias de la Salud

          Carrera de Medicina




                                              Profesora Bqca. Marcela Trapé
             BIOQUÍMICA


                 2012
                                                      1
Primera parte
                                          Proteínas




2




    Profesora Bqca. Marcela Trapé
Bibliografía
• Taniguchi N.    Capítulo 2.
  Aminoácidos y proteínas.
  Págs. 94-157. En Baynes JW;




                                Profesora Bqca. Marcela Trapé
  Dominiczak MH. Bioquímica
  Médica. 3° Ed. Barcelona:
  Elsevier; 2011.

                                        3
Funciones de las proteínas

Dinámicas

Catálisis del las reacciones químicas

Transporte
                  Albúmina
                  Hemoglobina y Mioglobina




                                               Profesora Bqca. Marcela Trapé
                  Transferrina

    Contracción
                  Miosina y actina

        Protección, combinación de funciones
        dinámicas
        Inmunoglobulinas e interferón
        Fibrina
                                                       4
Funciones de las proteínas


• Estructurales:
 • Tejido óseo y ligamentos
    • Colágeno y elastina
 • Piel y faneras




                                 Profesora Bqca. Marcela Trapé
    • α-queratina




                                         5
Origen de las proteínas                                ADN
Dogma central de la
Biología molecular
                                             Almacenamiento y herencia de la
                                                  información genética




                                                            Expresión de la información




                                                                                   Profesora Bqca. Marcela Trapé
      ARNm:       transporta      mensajes             ARN
      específicos desde el “banco de
      datos“ del núcleo al sitio de
      síntesis proteica en el citoplasma




                                                                                           6
Composición de las proteínas

                                     Esenciales              No esenciales
                                     Arginina                Alanina
• Son polímeros de         α-
  aminoácidos (AA).                  Histidina               Aspartato
                                     Isoleucina              Asparagina
• Se sintetizan a partir de 20
  AAs comunes.                       Leucina                 Cisteína
                                     Lisina                  Glutamato
• Pueden     contener    AAs
  derivados.                         Metionina               Glutamina
                                     Fenilalanina            Glicina
                                     Treonina                Prolina
                                     Triptofano              Serina
                                     Valina                  Tirosina


                             Profesora Bqca. Marcela Trapé              7
Estructura general de los AAs comunes
• Átomo de C central (α) al que se unen covalentemente a 4
  sustituyentes:
       Átomo de H
       Grupo ácido carboxílico (-COOH)
       Grupo amino (-NH2)
       Cadena lateral (-R) de estructura diferente para cada uno
  de los              20 AAs comunes. Grupo R.




                                                                   Profesora Bqca. Marcela Trapé
                                                                           8
Estructuras de los AAs alifáticos
              Monoamino, monocarboxílico

Alquil aminoácidos: cadenas laterales alquilo.




                            metilo                  isopropilo




                                                                 Profesora Bqca. Marcela Trapé
                                                 AAs sin carga
                                                 a pH
                                          β      fisiológico.
                 γ    isobutilo                                          9
Estructuras de los AAs aromáticos
                    Monoamino, monocarboxílico




              metileno




                                                     Profesora Bqca. Marcela Trapé
anillo bencénico          grupo fenólico     indol

                                                     10
 AAs sin carga a pH fisiológico.
Estructuras de los AAs
             que contienen S
          Monoamino, monocarboxílico

AAs que contienen S. Sin carga a pH fisiológico.




                                                   Profesora Bqca. Marcela Trapé
                                                   11
Estructuras de los AAs
                   polares neutros
                Monoamino, monocarboxílico

           Cadenas laterales con grupos alcohólicos




                                                           Profesora Bqca. Marcela Trapé
    hidroximetilo                     alcohol secundario



                                                           12
Sin carga a pH fisiológico.
Estructuras de los AAs ÁCIDOS
     Monoamino, dicarboxílico




                                Profesora Bqca. Marcela Trapé
            metileno




                                13
Estructuras de los AAs básicos
          Diamino, monocarboxílico




                                             Profesora Bqca. Marcela Trapé
                            metilenos


ε


                                             14
N-butilamina        guanidinio          imidazol
Estructuras de los AAs comunes
Monoamino, monocarboxílico




                                 Profesora Bqca. Marcela Trapé
                                 15
Estado de ionización de un aminoácido
               Determinación del pH isoeléctrico
    • pI = pH isoeléctrico: pH al cual un AA es eléctricamente
      neutro.
    • Zwitterion:
    • pI =    pKa´αCOOH + pKa´αNH3+ NO SIEMPRE

                          2
pKa´αCOOH=2,4 ; pKa´αNH3+ =9,6




                                                                 Profesora Bqca. Marcela Trapé
                                                                 16
Estado de ionización de un aminoácido
                 determinación del pI


pI= pKa´αCOOH + pKa´γCOOH=2,2+4,3=3,25
               2              2
     A pH> 3,25, AA tiene q neta < 0
     A pH< 3,25, AA tiene q neta > 0




                                                                          Profesora Bqca. Marcela Trapé
                                                                          17

                                         pKa´αCOOH=2,2 ; pKa´γCOOH=4,3; pKa
                                                   ´αNH3+=9,7
Relación general entre el pH y la carga de
         los aminoácidos y proteínas

Regla general:
• pH > pI → AA con carga negativa (q < 0)
• pH < pI → AA con carga positiva (q > 0)




                                                                Profesora Bqca. Marcela Trapé
pI = pH en que la proteína no se mueve en un campo eléctrico.
• pH > pI → proteína con carga negativa (q < 0)
• pH < pI → proteína con carga positiva (q > 0)




                                                                18
Separación de proteínas según su pI
                          pH = 8,6 > pI de
                            prots pl.
                          ⇒Proteínas: q
                            neta<0

                          Separación de
                            proteínas en




                                             Profesora Bqca. Marcela Trapé
                            bandas o picos




                                             19
Estructura primaria
                                        Proinsulina: cadena
              de la proteína        polipeptídica de 86 AAs y 3
                                   ptes disulfuro intracatenarios.
                                        Precursor inactivo.




                                                                       Profesora Bqca. Marcela Trapé
• Secuencia lineal de AAs unidos
  por enlaces peptídicos. Está
  predeterminada por la
  secuencia de nucleótidos de su
  gen.



                                                                       20
                                   Insulina biológicamente activa: 2 cadenas
                                     polipeptídicas de 21 y 30 AAs y 3 ptes
                                                    disulfuro.
Polimerización de AAs en péptidos y proteínas
         Enlace peptídico




           deshidratación




                                            Profesora Bqca. Marcela Trapé
1) Dipéptido, 2) Tripéptido …
n) Polipéptido … n+1)
  Proteína ( > 50 AAs)
Cadena polipeptídica: polímero
 que consiste en enlaces
                                            21
 peptídicos planos conectados
 por los átomos de carbono α.
Niveles superiores de organización de las
                proteínas

   • Estructura secundaria: plegamiento local de la
                secundaria
     cadena polipeptídica en la proteína.

   • Estructura terciaria




                                                      Profesora Bqca. Marcela Trapé
   • Estructura cuaternaria

   Conformación     nativa:
                    nativa      comprende       las
    estructuras secundaria, terciaria y cuaternaria
    única que adoptan las proteínas.                  22
Estructura secundarias regulares de las
                   proteínas
Hélice α
• Cada grupo peptídico forma dos puentes de hidrógeno
• Las cadenas laterales se encuentran en el exterior de la
  estructura en espiral.




                                                       Profesora Bqca. Marcela Trapé
                                                       23
Estructura secundaria de las
         proteínas
   Estructura β
   Unida por puentes de hidrógeno.
   Las cadenas laterales se proyectan por encima y
    por
   debajo de la estructura en hoja plegada.




                                                Profesora Bqca. Marcela Trapé
                                                24
Estructura terciaria de las proteínas
       Las proteínas forman estructuras tridimensionales




                                                     Profesora Bqca. Marcela Trapé
Tripsina




                                                     25
Estructura cuaternaria


•Ordenamiento de cadenas polipeptídicas en una
proteína con múltiples cadenas.




                                                        Profesora Bqca. Marcela Trapé
•Las subunidades que forman la estructura cuaternaria
deben encontrarse asociadas de manera no covalente.


•Ej.: la Hb –α2β2- unidas entre sí no covalentemente.
 Ej.:
Son 4 cadenas polipeptdícas.
                                                        26
Proteínas globulares

• Forma esferoidal
• Masas moleculares variables
• ↑ Solubilidad en H2O
• Diferentes funciones:
   catalizadores,




                                         Profesora Bqca. Marcela Trapé
  transportadores,
  reguladores de rutas metabólicas y
  reguladores de la expresión génica.




                                         27
Proteínas fibrosas

• Forma alargada (tipo bastón o cigarro).
• Mayor proporción de estructura secundaria regular.
• ↓ Solubilidad en H2O
• Función: estructural- soporte, protector o conectivo.
Ejemplos:




                                                          Profesora Bqca. Marcela Trapé
           Colágeno
           Elastina
           α-queratina
           Tropomiosina



                                                          28
Otras proteínas

  Lipoproteínas plasmáticas: complejos de lípidos y proteínas
                plasmáticas

Apolipoproteína
Clasificación según su
densidad:
•HDL
•LDL
•IDL
•VLDL
•Quilomicrones


 Ver Apl. Clínica: Las
 lipoproteínas se
                                                                29
 separan mediante
 ultracentrifugación.
 Pág. 220
            Profesora Bqca. Marcela Trapé
Otras proteínas

Glucoproteínas
Ej.: Proteínas de la membrana plasmática,
 sistema de antígenos sanguíneos (A, B y O),
N-glucosídico: entre el grupo amida de una Asn
 -glucosídico
 + un glúcido.




                                                 Profesora Bqca. Marcela Trapé
O-glucosídico: entre el grupo hidroxilo de una
  -glucosídico
 Ser o Thr + un glúcido.

Ejemplo de aplicación clínica:
Hemoglobina glicosilada, HbA1c

                                                 30
Muchas gracias




     Profesora Bqca. Marcela Trapé
31

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4° clase proteínas i

  • 1. Facultad de Medicina y Ciencias de la Salud Carrera de Medicina Profesora Bqca. Marcela Trapé BIOQUÍMICA 2012 1
  • 2. Primera parte Proteínas 2 Profesora Bqca. Marcela Trapé
  • 3. Bibliografía • Taniguchi N. Capítulo 2. Aminoácidos y proteínas. Págs. 94-157. En Baynes JW; Profesora Bqca. Marcela Trapé Dominiczak MH. Bioquímica Médica. 3° Ed. Barcelona: Elsevier; 2011. 3
  • 4. Funciones de las proteínas Dinámicas Catálisis del las reacciones químicas Transporte Albúmina Hemoglobina y Mioglobina Profesora Bqca. Marcela Trapé Transferrina Contracción Miosina y actina Protección, combinación de funciones dinámicas Inmunoglobulinas e interferón Fibrina 4
  • 5. Funciones de las proteínas • Estructurales: • Tejido óseo y ligamentos • Colágeno y elastina • Piel y faneras Profesora Bqca. Marcela Trapé • α-queratina 5
  • 6. Origen de las proteínas ADN Dogma central de la Biología molecular Almacenamiento y herencia de la información genética Expresión de la información Profesora Bqca. Marcela Trapé ARNm: transporta mensajes ARN específicos desde el “banco de datos“ del núcleo al sitio de síntesis proteica en el citoplasma 6
  • 7. Composición de las proteínas Esenciales No esenciales Arginina Alanina • Son polímeros de α- aminoácidos (AA). Histidina Aspartato Isoleucina Asparagina • Se sintetizan a partir de 20 AAs comunes. Leucina Cisteína Lisina Glutamato • Pueden contener AAs derivados. Metionina Glutamina Fenilalanina Glicina Treonina Prolina Triptofano Serina Valina Tirosina Profesora Bqca. Marcela Trapé 7
  • 8. Estructura general de los AAs comunes • Átomo de C central (α) al que se unen covalentemente a 4 sustituyentes: Átomo de H Grupo ácido carboxílico (-COOH) Grupo amino (-NH2) Cadena lateral (-R) de estructura diferente para cada uno de los 20 AAs comunes. Grupo R. Profesora Bqca. Marcela Trapé 8
  • 9. Estructuras de los AAs alifáticos Monoamino, monocarboxílico Alquil aminoácidos: cadenas laterales alquilo. metilo isopropilo Profesora Bqca. Marcela Trapé AAs sin carga a pH β fisiológico. γ isobutilo 9
  • 10. Estructuras de los AAs aromáticos Monoamino, monocarboxílico metileno Profesora Bqca. Marcela Trapé anillo bencénico grupo fenólico indol 10 AAs sin carga a pH fisiológico.
  • 11. Estructuras de los AAs que contienen S Monoamino, monocarboxílico AAs que contienen S. Sin carga a pH fisiológico. Profesora Bqca. Marcela Trapé 11
  • 12. Estructuras de los AAs polares neutros Monoamino, monocarboxílico Cadenas laterales con grupos alcohólicos Profesora Bqca. Marcela Trapé hidroximetilo alcohol secundario 12 Sin carga a pH fisiológico.
  • 13. Estructuras de los AAs ÁCIDOS Monoamino, dicarboxílico Profesora Bqca. Marcela Trapé metileno 13
  • 14. Estructuras de los AAs básicos Diamino, monocarboxílico Profesora Bqca. Marcela Trapé metilenos ε 14 N-butilamina guanidinio imidazol
  • 15. Estructuras de los AAs comunes Monoamino, monocarboxílico Profesora Bqca. Marcela Trapé 15
  • 16. Estado de ionización de un aminoácido Determinación del pH isoeléctrico • pI = pH isoeléctrico: pH al cual un AA es eléctricamente neutro. • Zwitterion: • pI = pKa´αCOOH + pKa´αNH3+ NO SIEMPRE 2 pKa´αCOOH=2,4 ; pKa´αNH3+ =9,6 Profesora Bqca. Marcela Trapé 16
  • 17. Estado de ionización de un aminoácido determinación del pI pI= pKa´αCOOH + pKa´γCOOH=2,2+4,3=3,25 2 2 A pH> 3,25, AA tiene q neta < 0 A pH< 3,25, AA tiene q neta > 0 Profesora Bqca. Marcela Trapé 17 pKa´αCOOH=2,2 ; pKa´γCOOH=4,3; pKa ´αNH3+=9,7
  • 18. Relación general entre el pH y la carga de los aminoácidos y proteínas Regla general: • pH > pI → AA con carga negativa (q < 0) • pH < pI → AA con carga positiva (q > 0) Profesora Bqca. Marcela Trapé pI = pH en que la proteína no se mueve en un campo eléctrico. • pH > pI → proteína con carga negativa (q < 0) • pH < pI → proteína con carga positiva (q > 0) 18
  • 19. Separación de proteínas según su pI pH = 8,6 > pI de prots pl. ⇒Proteínas: q neta<0 Separación de proteínas en Profesora Bqca. Marcela Trapé bandas o picos 19
  • 20. Estructura primaria Proinsulina: cadena de la proteína polipeptídica de 86 AAs y 3 ptes disulfuro intracatenarios. Precursor inactivo. Profesora Bqca. Marcela Trapé • Secuencia lineal de AAs unidos por enlaces peptídicos. Está predeterminada por la secuencia de nucleótidos de su gen. 20 Insulina biológicamente activa: 2 cadenas polipeptídicas de 21 y 30 AAs y 3 ptes disulfuro.
  • 21. Polimerización de AAs en péptidos y proteínas Enlace peptídico deshidratación Profesora Bqca. Marcela Trapé 1) Dipéptido, 2) Tripéptido … n) Polipéptido … n+1) Proteína ( > 50 AAs) Cadena polipeptídica: polímero que consiste en enlaces 21 peptídicos planos conectados por los átomos de carbono α.
  • 22. Niveles superiores de organización de las proteínas • Estructura secundaria: plegamiento local de la secundaria cadena polipeptídica en la proteína. • Estructura terciaria Profesora Bqca. Marcela Trapé • Estructura cuaternaria Conformación nativa: nativa comprende las estructuras secundaria, terciaria y cuaternaria única que adoptan las proteínas. 22
  • 23. Estructura secundarias regulares de las proteínas Hélice α • Cada grupo peptídico forma dos puentes de hidrógeno • Las cadenas laterales se encuentran en el exterior de la estructura en espiral. Profesora Bqca. Marcela Trapé 23
  • 24. Estructura secundaria de las proteínas Estructura β Unida por puentes de hidrógeno. Las cadenas laterales se proyectan por encima y por debajo de la estructura en hoja plegada. Profesora Bqca. Marcela Trapé 24
  • 25. Estructura terciaria de las proteínas Las proteínas forman estructuras tridimensionales Profesora Bqca. Marcela Trapé Tripsina 25
  • 26. Estructura cuaternaria •Ordenamiento de cadenas polipeptídicas en una proteína con múltiples cadenas. Profesora Bqca. Marcela Trapé •Las subunidades que forman la estructura cuaternaria deben encontrarse asociadas de manera no covalente. •Ej.: la Hb –α2β2- unidas entre sí no covalentemente. Ej.: Son 4 cadenas polipeptdícas. 26
  • 27. Proteínas globulares • Forma esferoidal • Masas moleculares variables • ↑ Solubilidad en H2O • Diferentes funciones:  catalizadores, Profesora Bqca. Marcela Trapé transportadores, reguladores de rutas metabólicas y reguladores de la expresión génica. 27
  • 28. Proteínas fibrosas • Forma alargada (tipo bastón o cigarro). • Mayor proporción de estructura secundaria regular. • ↓ Solubilidad en H2O • Función: estructural- soporte, protector o conectivo. Ejemplos: Profesora Bqca. Marcela Trapé Colágeno Elastina α-queratina Tropomiosina 28
  • 29. Otras proteínas Lipoproteínas plasmáticas: complejos de lípidos y proteínas plasmáticas Apolipoproteína Clasificación según su densidad: •HDL •LDL •IDL •VLDL •Quilomicrones Ver Apl. Clínica: Las lipoproteínas se 29 separan mediante ultracentrifugación. Pág. 220 Profesora Bqca. Marcela Trapé
  • 30. Otras proteínas Glucoproteínas Ej.: Proteínas de la membrana plasmática, sistema de antígenos sanguíneos (A, B y O), N-glucosídico: entre el grupo amida de una Asn -glucosídico + un glúcido. Profesora Bqca. Marcela Trapé O-glucosídico: entre el grupo hidroxilo de una -glucosídico Ser o Thr + un glúcido. Ejemplo de aplicación clínica: Hemoglobina glicosilada, HbA1c 30
  • 31. Muchas gracias Profesora Bqca. Marcela Trapé 31

Notas del editor

  • #2: Presentación Plan Trienal Bioq.. Marcela Trapé
  • #3: Presentación Plan Trienal Bioq.. Marcela Trapé
  • #4: Presentación Plan Trienal Bioq.. Marcela Trapé
  • #5: Presentación Plan Trienal Bioq.. Marcela Trapé
  • #6: Presentación Plan Trienal Bioq.. Marcela Trapé
  • #7: Presentación Plan Trienal Bioq.. Marcela Trapé
  • #8: Presentación Plan Trienal Bioq.. Marcela Trapé
  • #9: Presentación Plan Trienal Bioq.. Marcela Trapé
  • #10: Presentación Plan Trienal Bioq.. Marcela Trapé
  • #11: Presentación Plan Trienal Bioq.. Marcela Trapé
  • #12: Presentación Plan Trienal Bioq.. Marcela Trapé
  • #13: Presentación Plan Trienal Bioq.. Marcela Trapé
  • #14: Presentación Plan Trienal Bioq.. Marcela Trapé
  • #15: Presentación Plan Trienal Bioq.. Marcela Trapé
  • #16: Presentación Plan Trienal Bioq.. Marcela Trapé
  • #17: Presentación Plan Trienal Bioq.. Marcela Trapé
  • #18: Presentación Plan Trienal Bioq.. Marcela Trapé
  • #19: Presentación Plan Trienal Bioq.. Marcela Trapé
  • #20: Presentación Plan Trienal Bioq.. Marcela Trapé
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