Este documento discute tres desventajas potenciales de Debian GNU/Linux: 1) la falta de software comercial popular, aunque existen programas de código abierto equivalentes; 2) que GNU/Linux puede ser difícil de configurar aunque la instalación es fácil, y se está trabajando para mejorar la configuración; 3) que no todo el hardware está soportado, especialmente hardware nuevo, antiguo o raro, aunque la mayoría del hardware funciona y esta área también se está mejorando.