Los comandos internos del sistema operativo permiten solucionar problemas en la red, recuperar archivos y realizar otras tareas sin necesidad de tener el DOS presente. Algunos comandos comunes incluyen ERASE para borrar archivos, COPY para copiar archivos, y DIR para listar archivos y directorios. Estos comandos pueden usarse para crear una estructura de directorios, copiar y borrar archivos entre directorios, y resolver otros problemas que puedan ocurrir en Windows.