Como Python ajudou a automatizar o nosso laboratório v.2
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O documento descreve como a linguagem de programação Python pode ser usada para automatizar tarefas em laboratórios de análise clínica, incluindo a análise de variantes genéticas, gestão de processos laboratoriais e infraestrutura de servidores. O autor também fornece recursos para quem deseja aprender bioinformática e trabalhar com análises genômicas usando Python.
![Para quem não entendeu o que
o subprocess faz ainda….
https://docs.python.org/2/library/subprocess.html
>>> subprocess.check_output(["echo", "Hello World!"])
'Hello World!n'](https://image.slidesharecdn.com/genomikapugpe-141201110818-conversion-gate02/85/Como-Python-ajudou-a-automatizar-o-nosso-laboratorio-v-2-44-320.jpg)
Como Python ajudou a automatizar o nosso laboratório v.2
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- 35. It comes Python and Django!
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- 42. xenserver 1. 10 VM’s distribuídas em Darwin ,Mendel e Fisher 3. Debians, Windows Servers, Centos, etc.
- 43. backup , backup, monitor. Python nos ajudou a montar as rotinas de backup!! subprocess I love you!
- 44. Para quem não entendeu o que o subprocess faz ainda…. https://docs.python.org/2/library/subprocess.html >>> subprocess.check_output(["echo", "Hello World!"]) 'Hello World!n'
- 46. Desafios 1. Flask, Python, javascript, shell e python.
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- 51. Como posso começar na área de bioinformática já ?
- 52. Tales of Genome (Udacity) Curso On-line gratuito sobre Genética (bem completo!)
- 53. Rosalind rosalind.info/ Desafios de Python na área de bioinformática
- 54. Broad workshops https://www.broadinstitute.org/partnerships/education/broade/broad-workshops/ Variant analysis; sequencing pipelines, etc.
- 57. PS: Sim, usamos php! https://www.mediawiki.org/wiki/MediaWiki
- 58. Como Python pode ajudar a automatizar o meu laboratório Marcel Caraciolo marcel@genomika.com.br Novembro, 2014