La digestión de proteínas involucra la hidrólisis de enlaces peptídicos por enzimas como la pepsina en el estómago y enzimas pancreáticas como la tripsina en el intestino delgado. Estas enzimas descomponen las proteínas en polipéptidos y luego aminoácidos. Las peptidasas de los enterocitos completan la digestión a aminoácidos individuales, que son absorbidos en la sangre. Más del 99% de los productos finales de la digestión de proteínas son aminoácidos.