El Laboratorio de Salud Pública del Atlántico se enfoca en la vigilancia y análisis microbiológicos, toxicológicos y físico-químicos de agua, alimentos y medicina, con el objetivo de liderar en referencia diagnóstica y mejorar procesos de salud pública. Sus funciones incluyen la detección y control de patologías, soporte técnico en brotes, y la ejecución de investigaciones sobre enfermedades tropicales y genéticas. La institución busca acreditación y mejora continua en calidad, colaboración con redes de laboratorios y el fortalecimiento del sistema de salud pública nacional.