Proteomica.ppt
- 1. Proteómica
- 2. ¿Cómo abordamos el estudio y comprensión de un sistema biológico?
- 4. nisina
- 5. Genoma: representación estatica de una sistema biológico. Transcriptoma: representación de la expresión génica en estado fisiológico determinado. Proteoma: Visión integrada de las proteínas en un proceso biológico.
- 6. 1. Si y cuándo un RNA se traduce. 2. La concentración relativa de productos génicos. 3. Modificaciones postraduccionales. 4. Represiones y sobreexpresiones génicas. 5. Fenotipos resultantes de la actuación de múltiples genes. A partir de la secuencia del DNA no se puede predecir:
- 7. • Sistemático: estudio global de la expresión proteica, es decir, identificación de todas las proteínas en referencia a un estado fisiológico determinado. • Pragmático: propone comparar la expresión proteíca de dos situaciones fisiológicas y establecer mapas bidimensionales. La proteómica plantea objetivos complementarios:
- 8. 1. Sistemático. Analizar: • Modificaciones postraduccionales. • Localización subcelular. • Interacción con otras moléculas. • Estado fisiológico de la toma de muestra. 2. Pragmático. Estudios de expresión diferencial de proteínas en diferentes estados fisiológicos: • Medicina. • Toxicología. • Farmacología. Aplicación
- 9. 1. SEPARAR LAS PROTEÍNAS • Preparar la muestra. • Tecnicas de separación: Cromatografía. Electroforesis 2D. 2. MEDIR ALGUNA PROPIEDAD INTRINSECA: • Masa, espectrometría de masas. 3. COMPARACIÓN CON BASES DE DATOS. • PMF = Peptide Mass Fingerprinting. ¿Cómo se caracteriza una mezcla proteica?
- 10. Isoelectroenfoque Una solucion de anfolitos es incorporada en un gel Se genera un gradiente estable de pH tras la aplicación de un campo eléctrico Se añade una solución con proteínas y se reaplica un campo eléctrico Tras la tinción, las proteínas aparecen distribuidas a lo largo del gradiente de pH de acuerdo con su valores de pI
- 11. Electroforesis bidimensional Primera dimensión: Isoelectroenfoque Segunda dimensión: Electroforesis en gel de poliacrilamida/SDS El gel de isoelectroenfoque se situa en un gel de de poliacrilamida/SDS
- 12. Mas de 1000 proteínas de E. coli
- 16. ICAT
- 17. Identificación y caracterización de proteínas por espectrometría de masas
- 18. Identificación y caracterización de proteínas por espectrometría de masas