Proteómica
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La proteómica estudia el proteoma, que es el conjunto de proteínas expresadas por un genoma, célula u organismo en un momento dado y bajo ciertas condiciones. Permite identificar, categorizar y clasificar proteínas según su función y las interacciones que establecen. Se usa para identificar marcadores de enfermedades, nuevos fármacos y mecanismos moleculares involucrados en patologías. Las técnicas de proteómica incluyen electroforesis, espectrometría de masas y sistemas para estudiar interacc
Proteómica
- 1. Proteómica QFB Roger Iván López Díaz
- 2. Proteoma Es el conjunto completo de proteínas expresadas por un genoma, una célula u organismo. Es el conjunto de proteínas expresadas en un tiempo dado, bajo condiciones dadas. La proteómica trata sobre el estudio de proteómas. De forma más especifica, proteómica incluye un análisis simultaneo de las proteínas existentes en una célula (cuantificación de proteínas, determinación de su ubicación, modificaciones, etc).
- 3. Uso Permite identificar, categorizar y clasificar las proteínas con respecto a su función y a las interacciones que establecen entre ellas. De este modo, se pueden caracterizar las redes funcionales que establecen las proteínas y su dinámica durante procesos fisiológicos y patológicos. Identificación de nuevos marcadores para el diagnóstico de enfermedades. Identificación de nuevos fármacos. Determinación de mecanismos moleculares involucrados en la patogenia de enfermedades. Análisis de rutas de transducción de señales.
- 4. Proteómica La proteómica de expresión se encarga del estudio de la abundancia relativa de las proteínas y de sus modificaciones postranscripcionales. La proteómica estructural se encarga de la caracterización de la estructura tridimensional de las proteínas. La proteómica funcional se encarga de la localización y distribución subcelular de proteínas y de las interacciones que se producen entre las proteínas y otras moléculas con el fin de determinar su función
- 6. Técnicas empleadas para analizar globalmente el proteoma y separar sus proteínas Electroforesis bidimensional. DIGE (Difference In Gel Electrophoresis: electroforesis diferencial en gel). ICAT (Isotope-Coded Affinity Tags: marcaje isotópico diferencial). MudPIT(Multidimensional Protein Identification Technology: tecnología de identificación de proteínas multidimensional).
- 7. Técnicas usadas para analizar individualmente las proteínas Espectrometría de masas. MALDI-TOF (Matrix-assisted laser desorption/ionization Time Of Flight: desorción/ionización mediante láser asistida por matriz en “tiempo de vuelo”). SELDI_TOF-MS (Surface Enhanced Laser Desorpcion Ionization Time Of Flight Mass Spectrometry: espectrometría de masas en "Tiempo de Vuelo" mediante desorción/ionización por láser de superficie). MS/MS (Mass Spectrometry/ Mass Spectrometry: espectrometría de masas en tándem). Con estas técnicas se obtiene la huella peptídica (peptide mass fingerprint). La huella peptídica es el conjunto de fragmentos peptídicos que se obtienen tras tratar una proteína concreta con una proteasa determinada.
- 8. Técnicas que se usan para estudiar interacciones entre proteinas Sistemas “yeast two hybrids”. Técnica “Phage Display”. -permite averiguar con qué proteínas interacciona una proteína problema o sonda.