La interacción génica epistática ocurre cuando un gen enmascara el efecto de otro gen en un locus diferente, alterando las proporciones mendelianas esperadas. Por ejemplo, en los perros labradores, el gen recesivo e enmascara la expresión de los alelos de color en el primer locus, dando como resultado 9 negros, 3 marrones y 4 amarillos. Otro ejemplo es la interacción entre los loci que determinan el color del zapallo, donde el alelo dominante W enmascara la expresión del segundo locus, dando como resultado 12